食品药品监管部门负责流通环节管理。嵊州市疾控中心在市卫计委的领导下，以疾病防控需要和社会公众对于第二类疫苗接种的需求等为依据，通过公开、公平、公正的方式来选择适用于本市的第二类疫苗品种，以满足市民对于第二类疫苗的接种服务需求，根据使用计划向疫苗生产企业或疫苗批发企业统一采购国家批准使用的第二类疫苗；通过委托专业医药物流企业实行统一储存和配送。

本市有健全的疫苗管理制度，为确保疫苗质量，所有嵊州市内疫苗从配送储存和接种使用环节均规范地实施冷链温度监控。根据国家规范及市级相关要求，嵊州市疾控中心和各预防接种单位采用生物制品管理信息系统按日期、疫苗品种、剂型、批准文号、数量、规格、批号、有效期和在途温度记录做好疫苗出入库的完整记录；按规定索取生产和批发企业资质文件、批签发合格证明编号或者合格证明等内容，并妥善保存至超过疫苗有效期2年备查。

卫生行政部门负责第二类疫苗接种服务管理。全市254家社区接种门诊、29家犬伤处理门诊和39家特需接种门诊，均在卫生主管部门的验收审核备案下提供了疫苗接种服务，近6000名预防接种工作人员均经过培训持证上岗。接种门诊按规定张贴了疫苗价格和信息公示。同时，本市对所有接种的疫苗开展疑似预防接种异常反应监测，近期的监测结果显示，不良反应发生率平稳，无异常信号发生。